本家のリポジトリを使ったMySQLの5.6.47 から 5.6.48 のアップグレードが失敗する。 /usr/bin/mysqld_safe のスクリプトが間違っているっぽい。 データディレクトリが /usr/data になってしまう。 OSもMySQLも古いバージョンだから、メンテされていないのか…